Hoewel eieren vaak in de koelkastdeur worden bewaard, schommelt de temperatuur er bij elke opening en sluiting.
Hierdoor ontstaat een omgeving waarin bacteriën zich gemakkelijk kunnen vermenigvuldigen en de beschermende schaal van het ei kunnen verzwakken. Hierdoor is de kans op besmetting groter en bederven de eieren sneller.
Om te voorkomen dat ze geuren of smaken van andere producten in de koelkast absorberen, moeten eieren worden bewaard in speciale trays of bakjes met deksel. Het is het beste om de tray of eierdoos in het midden of in de diepere delen van de koelkast te plaatsen, waar de temperatuur constant onder de 20 °C is.
Uit veel onderzoeken is gebleken dat verse eieren die op kamertemperatuur worden bewaard, hun kwaliteit verliezen na een paar dagen en binnen 1 tot 3 weken gegeten moeten worden.

Gekoelde eieren behouden hun kwaliteit en versheid daarentegen minstens twee keer zo lang als eieren die op kamertemperatuur worden bewaard. Deskundigen adviseren echter om eieren niet langer dan 3-5 weken te bewaren om te voorkomen dat oude eieren worden opgebruikt.
